Молодой, энергичный и смышленый парень смело берется за дело, когда неожиданно на помощь приходит бывший коллега его отца. К обоюдному удивлению они обнаруживают, что способности понимать покемонов передались и Тиму. И пусть некоторые из них настроены весьма враждебно, он свободно общается с новым другом и помощником, когда другие люди слышат лишь смешные повторяющиеся звуки вроде «пика пика». Вдвоем они отправляются по следам отца Тима - Гарри Гудмана. Находят многочисленные улики, оставленные в разных частях большого мегаполиса Райм-Сити. Но ни Тим, ни Пикачу и не подозревают, что шаг за шагом приближаются к разгадке гораздо более опасного заговора, угрожающего нарушить мир между жителями планеты. Теперь именно от наших героев зависит мирное сосуществование двух различных видов.